כאשר נתניהו מינה את תמיר פרדו לעמוד בראשות המוסד, הוא עשה זאת בתנאי שיוסי כהן ימונה להיות סגנו. כך פורסם בחדשות 13 לאחר שנתניהו התראיין אמש ואמר כי "בממשלה שאני אקים, אני אדע לנצל את כישוריו של יוסי כהן"