בשל תנאי מזג האוויר והסיכון משטפונות בנחלים, מסלול נחל ערוגות בשמורת עין גדי נסגר למטיילים. וגם בית הכנסת העתיק בשמורה פתוח למבקרים. כמו כן, נסגרו גם מסלולי נחל דרגה ונחל אוג, וכל מסלולי הסנפלינג בנחלי מדבר יהודה